Pada awal berdirinya, SMP Katolik adalah merupakan sebuah Lembaga Kursus Bahasa Inggris yang dikelola oleh Pastor – pastor SSCC dari Lembaga Keuskupan Singapura. Lembaga Kursus ini mendapat perhatian dihati masyarakat setempat pada saat itu khususnya masyarakat sekitar Kota Tanjungpinang. Sehubungan dengan minat masyarakat yang semakin meningkat akhirnya lembaga ini mendirikan sekolah SMP Katolik dengan meminjam gedung SD Katolik untuk digunakan belajar sore hari. Kepala Sekolah yang pertama secara resmi terpilih saat itu adalah Bapak K.A.S. Fernandez sampai dengan Juni 1987. Tahun Pelajaran Baru Juli 1987/ 1988 Sekolah SMP Katolik pindah ke gedung baru di Jalan Batu Kucing No. 32 Batu lima atas Kelurahan Kampung Bulang Kecamatan Tanjungpinang Timur Kota Tanjungpinang dengan Kepala Sekolah terpilih adalah Bapak D. S. Simanjuntak. Lalu dilanjutkan oleh Kepala Sekolah F. Sunarno Juli 1988 – Juni 1997, kemudian digantikan oleh Bapak P. Yudhisto Kristy Juli 1997 – Juni 2003, lalu dilanjutkan oleh Ibu Fransisca Kayatun Juli 2004 – Juni 2007. Periode Juni 2007 – Juli 2008 digantikan oleh Bapak Hieronymus Emillianus Sunarta, S.Pd, kemudian dilanjutkan oleh Bapak Thomas Mas Leden, S.Pd pada periode Juli 2008 – Juni 2012, setelah itu lanjutkan oleh Ibu Sri Martini, S.Pd periode 1 Juli 2012 – 1 Juni 2016, kemudian dilanjutkan oleh Bapak Selamat Simarmata, S.Si periode 1 Juli 2016 hingga sekarang.
